1、α线：上铃羽结局：凶真和铃羽一起回到1975年。琉华结局：真由里死去，凶真带着愧疚和琉华一起生活，结婚生子。菲利斯结局：菲利斯的父亲没死，凶真在这条线上，变的除了菲利斯之外和其他人没有了联系（甚至真由里和桶子都没和凶真认识），所以也就没了时间跳跃机器，无法再次改变世界线。
2、菲利斯结局：冈部没有牺牲菲利斯的父亲去救振宇，而是发了一封新的邮件。世界线的变化率变为负值。菲利斯和冈部是这条新世界路线上的情侣。菲利斯的父亲雅之和他的助手并没有死，但是冈部的关系发生了戏剧性的变化（他和Tuki不再是朋友，也不认识雅之）。冈部打算尝试在这条新的世界线上生活。
3、动画的主线故事在第一季《命运石之门》中得到了圆满的结局，主角冈部伦太郎成功地进入了所谓的“命运石之门”世界线（SG线），这是一个没有战争、没有悲剧的完美结局。随后，制作方推出了《命运石之门0》（Steins；Gate0），这部作品是对第一季中提到的β世界线（Beta世界线）的深入探索。
1、助手结局：冈部知道为了救珍由理，他必须在被他推到之前牺牲他的助手。两人感情确定后，刀助理计划返回美国。当Okabe决定按delete键时，助手会出现并向Okabe确认（未完成）。冈部跳回到beta线。
2、游戏中一共有 6 条路线，前 5 条是普通结局，最后是真结局（TV版结局），当然可以直接打真结局，不过还是建议看完所有的结局后再玩真结局，原因就不说了，玩过就会明白。
3、特殊TIPS回收：在街上的时候，红莉栖的来电，不要马上接听。 特殊TIPS回收：在LAB里的时候，红莉栖的来电，不去接听。 在LAB对于魔笛的调查后，给真帆打电话 。一般全路线完成的话，就基本收齐了，下面两个比较容易漏掉。与真帆取得联络之后，回应Amadeus的联络 。
4、凶真只有和菲利斯一起生活下去。β线：真由里结局：好不容易跳到β线的凶真放弃了拯救助手，和真由里一起生活。助手结局：也就是Ture End了，真有理没死，助手记忆都在。《命运石之门》，是MAGES的志仓千代丸策划和编写的游戏，该游戏由角川书店发行。
5、真结局：冈部到达β线后，和这条线的铃羽会面。铃羽将未来冈部提出的作战告知他，让他坐时间机器回到28救助手。
牧濑红莉栖。命运石之门真结局是男主和女主牧濑红莉栖在一起，冈部在未来的自己的提醒下，一次使用时空机回到牧濑红莉栖将要被害的时间段，用自己的鲜血制造牧濑红莉栖死掉了假象，从而救牧濑红莉栖。
α线：上铃羽结局：凶真和铃羽一起回到1975年 琉华结局：真由里死去，凶真带着愧疚和琉华一起生活，结婚生子 菲利斯结局：菲利斯的父亲没死，凶真在这条线上，变的除了菲利斯之外和其他人没有了联系（甚至真由里和桶子都没和凶真认识），所以也就没了时间跳跃机器，无法再次改变世界线。
《命运石之门》结局是冈部最后不愿意再牺牲回忆，最终真由理死在了CM会场。最后琉华子和冈部一起背负着这个罪孽活下去，冈部也没有再被SERN为难，二人结婚生子。