玩过弹头（孤岛危机1系列的版本）的我个人认为以赛可铁骨热血的性格应该是自己去报仇的（第二种观点中有部分观点认为赛可在最后的战役中死了。实际上先知因为生化服的缘故被吸入太空，赛可仍待在地面应该无恙）。所以最后的片段正如其名：“赛可的申诉”。
先知是落在了孤岛危机1中大家所熟悉的灵山岛上，那是孤岛危机系列故事的开始，也是孤岛危机系列故事的结束。并不是说先知掉到地球上后醒来就在床上，制作队伍特别将中间不必要的内容减掉。
“这时阿卡特兹从废墟里出来，对那个人说：“他们叫我先知”那一幕特帅。所以三代主角就是“阿卡特兹”还有个第二主角“赛可”。“赛可”就是那个孤岛危机弹头里面的主角。至于一代的主角“诺曼”他死了，在孤岛危机：残骸里被火烧死。
《孤岛危机3》的剧情是关于一场反抗CELL集团压迫的战斗和对外星人Alpha Ceph的追踪。不过推动故事发展的还有主角Prophet 和他的跟班Michael ‘Psycho’ Sykes之间的关系。一个人拼命想保留住自己身上最后一点人性，另一个人则是刚刚被剥夺了纳米盔甲，要为自己报仇雪恨。
赛可没有死，主角纳米服进行了终级进化，变成了和外星人一样的外骨骼，但是比外星人的更先进，可以任意改变外形。所以，先知把外形改变成了以前巴恩斯的长像，最后成为了一个全新的物种，既不是人类也不是外星人。
结局动画中，先知似乎于灵山岛隐居中，收音机拨放的演讲内容也暗示前作的CIA特工史崔克兰当选参议员，并领导重建秩序。其纳米服中的神经块被移除，衣服的外层变成了先知原来的身体，使他重获新生。
玩过弹头（孤岛危机1系列的版本）的我个人认为以赛可铁骨热血的性格应该是自己去报仇的（第二种观点中有部分观点认为赛可在最后的战役中死了。实际上先知因为生化服的缘故被吸入太空，赛可仍待在地面应该无恙）。所以最后的片段正如其名：“赛可的申诉”。
也是孤岛危机系列故事的结束。并不是说先知掉到地球上后醒来就在床上，制作队伍特别将中间不必要的内容减掉。请注意在结尾的制作人员表放完后等一段时间，会跳出一段彩蛋，指明了赛可还活着，同时赛可还说他在战争结束后进入了Cell的其中一家医院，之后就来找Cell公司的老总算账了。
而CELL老总为了收集纳米服，并且排除对自己不忠心的士兵，对这些先知的老部下进行了剥皮：强行剥夺纳米服。纳米服与士兵的连接深入骨骼神经，强行剥夺纳米服对这些士兵造成了极大的伤害与痛苦。除了孤岛危机：弹头中作为主角的赛可挺了过去以外，其他纳米服士兵，包括诺曼，全部惨死于剥皮实验室。
因为克莱尔当初没有告诉赛可是她自己剥了赛可的皮（好像剥皮不是一般的疼），赛可认为克莱尔还有先知欺骗了他（其实先知不知道），就气走了。
这里存在两种观点，一种观点认为塞可之前在非自愿情况下被CALL公司剥皮，最后去报复CALL高管；另一种观点是先知拥有自由的纳米生化服后伪装成赛可报复CALL。玩过弹头（孤岛危机1系列的版本）的我个人认为以赛可铁骨热血的性格应该是自己去报仇的（第二种观点中有部分观点认为赛可在最后的战役中死了。