1、回到绿岭市。抓了代欧奇希斯后回到绿岭市。进宇宙中心打格拉吉欧。这跟剧情无关，也可以不打，属性空也可以不抓。
2、口袋妖怪究极绿宝石小智版抓完代欧奇希斯后可以给代欧奇希斯提升等级，然后去冠军之路或者联盟。
3、要听话的去9岛，得用金手指，有一个红三角，每次必须以最短路线接近它，到最后会出来一只30级的防御状态。详情去http：// 顺便告诉你在精灵塔捉到的是永远不会听话的。
4、上天后我们展现出背包中的裂空座就可以来到宇宙了。在宇宙深处找到代欧奇希斯打败或捕捉，之后裂空坐爆发出究极的力量打破了陨石拯救了丰源，龙系天王也向丰源人民发了通知。
5、雷公，炎帝，水君：捕捉条件：通关后可以在东地区草地随机遇到，遇到就会跑。凤王、露琪亚：捕捉条件：凤王和露琪亚并不能通过游戏剧情捕捉，你需要参加官方的现场活动才可以触发捕捉事件。当然如果你是模拟器玩家，就可以直接通过金手指到达捕捉地点。
打败研究员后就可以夺回蓝宝石。过后带着蓝宝石回到1号岛的PC屋，将之交给博士。博士就会把通讯机器修理好，现在就可以和宝石版以及NGC的竞技场通讯了……剧情进行到这里，就可以进入超梦山洞了，不过先别着急，还是先坐船到7号岛。
有必要，打完第二次四大天王才算正式通关。后面难度就打了。比如说训练师塔，里面所有的怪等级都和你最强的怪一样。很有挑战性。第二次打四大天王难度也大了很多。
去打天王，打完之后就可以二周目（算是二周目吧……），然后就可以去那些以前不让进去的地图里收集珍稀怪啦。
去水道馆左上方的洞穴抓超梦。去2岛生蛋，能收集一些新PM。
通关之后不需要再抓，按理说箱子不可能慢这么快啊。其实不需要重复捕捉，顶多每种PM一公一母，但也不需要，因为一公一母出了生蛋其他没什么用，而+图鉴只要捕捉一次就OK了。
打完后是开始新的小段剧情。去水道馆左上方的洞穴抓超梦。去2岛生蛋，能收集一些新PM。
口袋妖怪叶绿中文版打完四大天王后可以坐船去七岛，完成了七岛红蓝宝石剧情后还可以去超梦洞捉超梦。还可以再次挑战四天王，这次四天王的神奇宝贝可是厉害很多了呦。而且打完四天王后如果捉到的神奇宝贝种类超过60还可以开启全国图鉴，可以在关东本土捉到金银的神奇宝贝，利用红蓝宝石联机集齐386种神奇宝贝。
通关一遍，抓住超过60种精灵，然后去博士那里升级成386版图鉴，之后到港口坐船去第一个小岛的火焰山，右边有两个火箭队队员，打败他们进入山洞，在山洞中要使用秘传机04怪力推石头后才能到达深处，得到红宝石。回去在1号岛的PC把宝石给博士，便得到船票，之后可以坐船去7个岛。
第二次通关了那就没什么剧情了，接下来也就是去抓抓精灵，努力去完成图鉴，再去锻炼锻炼精灵什么的了。都干完了那可以去换个游戏去玩玩。
口袋妖怪叶绿中文版打完四大天王后可以坐船去七岛，完成了七岛红蓝宝石剧情后还可以去超梦洞捉超梦。还可以再次挑战四天王，这次四天王的神奇宝贝可是厉害很多了呦。而且打完四天王后如果捉到的神奇宝贝种类超过60还可以开启全国图鉴，可以在关东本土捉到金银的神奇宝贝，利用红蓝宝石联机集齐386种神奇宝贝。
去水道馆左上方的洞穴抓超梦。去2岛生蛋，能收集一些新PM。
抓完超梦就意味着游戏里的主线剧情都已经完成了。接下来可以做的就是这些事情了：尽可能的去收集图鉴，不过152-386号的精灵大部分都需要从宝石版里面传过来。锻炼精灵，都让它们升到100级最好。用对战搜索器反复和沿途的训练师对战。
通关后，你会回到家里。爸爸会给你一张船票，以后就可以去卡依市或者阿田市坐船了。之后看电视，上面说有不明精灵在芳园地区飞行，妈妈问你是蓝水督还是红水督，你选择哪只，以后就会遇到哪只水督。走出屋子，博士会帮你把图鉴升级为386版，之后在芳园地区就可以抓到金银版的精灵了。
首先要确定你的叶绿是386版的。如果是的话还记得打完第7个道馆（在红莲岛，如果记得没错的话是火系道馆）后有人把你带到一个新岛上吧，就是那个分为1号岛、2号岛、3号岛的地方。