1、神秘水晶事件 神秘水晶通过任天堂官方活动获得，带去尼比市博物馆，与宝石系列的冠军代后对话，换得心之水滴，之后，另外一只水都出现。 阿鲁夫遗迹，创世神事件。
2、口袋妖怪金心银魂三周目有三个场景需要进行通关，分别是：三圣鸟；雪拉比时空穿越事件；水都兄妹。三圣鸟：此剧情需要击败小智后触发三圣鸟均为50级。闪电鸟：闪电鸟会被抢占发电站的工作人员赶出了家门，只好站在发电站门口。冰冻鸟：冰冻鸟还宅在双子岛，从右下入口处进去比较快。
3、去真新找大木要初代御三家（三选一），去西鲁夫公司找大吾要芳缘御三家，然后练怪；去战斗设施打发时间；狩猎场捉怪；集图鉴；二周目战馆主。
剧情进行到给山吹市的小妹妹找车票时，从最喜欢口袋妖怪俱乐部要了娃娃出门时会遇到方缘地区的冠军大吾，他会给主角看水都的照片，金心为红水都，银魂为蓝水都，并告诉主角水都目前正出没在关东地区。这之后水都就在关东地区随地乱跑了，50级，见面就跑。
海皇牙&古拉顿 此剧情需要完成并领取6剧情的关东三主角后触发 在30号道路可以找到口袋妖怪爷爷的家（就是上来拿图鉴的小屋），他会告诉你收到了大木博士的信，并交给你一块宝玉，金心是あいいろのたま蓝色宝玉，银魂则是にじいろのたま虹色宝玉。
这时候就可以去圆朱市捉凤王（金心版）/41号海域捉洛基亚（银魂版）了。笔者玩的是银魂版，对金心有爱的请点击这里看金心捕捉凤王的过程。捕捉洛基亚：从湛蓝市右行来到41号海路。洛基亚的洞窟应该有4个入口，也对应4个漩涡。见到的第一个漩涡是位于左下角的，辗转一圈来到右上角的漩涡。
谁能推荐一本金心银魂的攻略给我（实体书），要求是要有每一条道路，每一个城市的图片，能一眼看清什么地方有什么人，或者可以捡道具。小时候在GBC上玩金银的时候有本香港出的攻略就是这样的，可以说是一览无遗啊。大陆，港台的都可以，只要符合要求。
心金魂银版是周目最多的版本，一共3周目。神奇宝贝心金版（日文︰ポケットモンスター ハートゴールド，英文︰Pokémon HeartGold Version）与神奇宝贝魂银版（日文︰ポケットモンスター ソウルシルバー，英文︰Pokémon SoulSilver Version）是金银版在任天堂DS上的重制游戏。
在关东的ニビシティ尼比市右侧出口的高地上可以找到一位老人，他会给你银色羽毛。（银魂版是七色羽毛）带着这个羽毛去心金：漩涡列岛（魂银：铃塔）就可以让看门的和尚让路，进去到瀑布深处（魂银“塔顶）和路基亚（魂银：凤凰）战斗。
心金魂银版。口袋妖怪周目最多的版本心金魂银版是周目最多的版本，一共3周目，神奇宝贝心金版与神奇宝贝魂银版是金银版在任天堂DS上的重制游戏。
用WIFI……去下一些RANGER3的任务，传到心金里。去运动会，把奖杯拿全。练极品PM，找朋友对战。顺便把能和NPC交换到的PM都换了。去沙狐乐园放东西，抓PM。
可以进，但打完小智后去精灵爷爷家得到红色宝玉（魂银）/蓝色宝玉（心金）才能遇到神兽。水都（皮皮玩偶事件后）炎帝雷皇（烧焦塔事件后）都是地图上瞎逛的，都是见面就跑。水君从烧焦塔逃走后 第一次在湛蓝市上方遇见，不触发战斗，溜之大吉。